אגף שומת מקרקעין במשרד המשפטים עוסק בעריכה של שומות לנכסי מקרקעין שלמדינה או מוסדותיה עניין בהן, ובבקרה על שומות אלו. חובת הזיקה של משרדי הממשלה לשירותיו של השמאי הממשלתי נקבעה בהחלטת ממשלה שעל פיה השמאי הממשלתי מוסמך להעריך את שווי הקרקעות שמשרד ממשלתי מתכוון לרכוש, להחכיר, להפקיע, למכור, להשכיר או לשכור. השומות נערכות למטרות שונות, כגון מכרזי קרקע, אמדן פיצויים בגין הפקעות מקרקעין או ירידת ערך של המקרקעין, מכירת ורכישת נכסים, רכישת זכויות בדירות מוגנות, תשלומים למינהל כמו דמי הסכמה ודמי היוון, והשכרת נכסים לדיור הממשלתי. השמאי הממשלתי הראשי ומנהלי הלשכות מייעצים בניהול מקרקעין ובפעולות פינויים, רכישה והפקעה. בראש האגף עומד השמאי הממשלתי הראשי, ולהנהלת האגף בירושלים כפופות שלוש לשכות מחוזיות: תל אביב, חיפה וירושלים. הלשכה בירושלים ממונה גם על הפעילות בבאר שבע וביהודה ושומרון. לכל לשכה מנהל, סגן מנהל, שמאים מחוזיים ומתמחים. עובדי האגף משתתפים בוועדות מטעם משרדי ממשלה, כחברים, משקיפים ויועצים.