לכל מחוז של משרד הפנים יש ועדה מחוזית לתכנון ולבנייה, שבראשה יושב הממונה על המחוז מטעם משרד הפנים. הוועדה מורכבת ממתכנן המחוז, נציגי שמונה משרדי ממשלה, נציג מינהל מקרקעי ישראל, חמישה נציגי רשויות מקומיות, אדריכל או מהנדס ונציג של הגופים הציבוריים שעניינם בשמירת איכות הסביבה. תקופת כהונתה של ועדה מחוזית היא חמש שנים. כל סטייה מהוראות תוכנית מתאר מקומית מצריך אישור של הוועדה המחוזית. הוועדה המחוזית מכינה ומגישה למועצה הארצית תוכניות מתאר מחוזיות, מעירה את הערותיה על תוכניות מתאר ארציות ודנה בהתנגדויות לתוכניות מתאר מקומיות ותוכניות מפורטות שמגישות לה הוועדות המקומיות. היא מחליטה בדבר אישור, דחייה או תיקון של תוכניות אלה. ועדות מחוזיות קיימות במחוזות צפון, חיפה, מרכז, תל אביב, ירושלים ודרום.